学校现有国家级科研平台1个，省、部级重点实验室8个，省部级工程实验室3个，省部级实验站3个，省部级协同创新中心2个，国家级星创天地1个，省级众创空间1个，“十三五”期间，学校新获批7个省部级及以上科研平台，获批国家地方联合工程实验室1个（南疆特色果树高效优质栽培与深加工技术国家地方联合工程实验室），新建5个校级科研平台，科研平台的学科布局更趋合理。
国家重点实验室培育基地
塔里木盆地生物资源保护利用省部共建国家重点实验室培育基地
国家地方联合工程实验室
南疆特色果树高效优质栽培与深加工技术国家地方联合工程实验室
省、部级重点实验室
1、塔里木畜牧科技兵团重点实验室
2、南疆特色农产品深加工兵团重点实验室
3、南疆农业有害生物综合治理兵团重点实验室
4、塔里木盆地生态保护与生物资源利用国际合作基地
5、现代农业工程重点实验室
6、非传统安全与边疆治理研究院
7、胡杨精神研究院
8、西域文化研究院
省部级专业（工程﹞实验室
1、best365网页版登录官网兵团南疆特色果树生产工程实验室
2、新疆兵团南疆化工资源利用工程实验室
3、新疆兵团塔里木动物疫病诊断与防控工程实验室
省部级研发中心
1、农业部西北区域农业微生物资源利用科学观测实验站
2、农业部阿拉尔作物有害生物野外观察实验站
3、农业部农产品质量安全风险评估实验站
省部级协同创新（培育﹞中心
1、西域文化与丝路文明共享协同创新（培育﹞中心
2、环塔里木生态农业协同创新（培育﹞中心
国家级星创天地
新疆生产建设兵团best365网页版登录官网环塔电商星创天地
兵团级众创空间
西域文化遗产数字化大学生创客空间
国家语言文字推广基地
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